非洲豬瘟是由病毒感染引起的豬的一種急性、烈性、高度接觸性傳染病。記者24日了解到,中國科學(xué)院昆明動物所近期牽頭的非洲野生豬科動物遺傳資源挖掘研究,為家豬抗病育種提供了關(guān)鍵理論依據(jù)和技術(shù)支撐。
自1921年非洲豬瘟在肯尼亞首次報道以來,現(xiàn)已擴散到全球。它雖不是人畜共患病,但豬感染后,發(fā)病率和病死率可高達100%,造成巨大經(jīng)濟損失和社會影響,世界動物衛(wèi)生組織將其列為法定報告動物疫病,我國將其列為一類動物疫病。
在撒哈拉以南的非洲地區(qū),非洲豬瘟病毒通過軟蜱蟲在野生豬科動物之間形成野外傳播鏈。經(jīng)過長期進化,包括疣豬屬、巨林豬屬等在內(nèi)的非洲野生豬科動物,對該病毒產(chǎn)生了天然抗性,表現(xiàn)為宿主可攜帶非洲豬瘟病毒,但無臨床癥狀,是研究非洲豬瘟抗性形成的寶貴遺傳資源。
昆明動物所張亞平院士團隊發(fā)揮對非合作優(yōu)勢,聯(lián)合國際家畜研究所和尼日利亞國家公園管理局等研究力量,運用三代長片段測序技術(shù),構(gòu)建了普通疣豬和紅河豬的高質(zhì)量基因組。同時,依托西南家豬分子育種與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究基地,研究團隊還構(gòu)建了高質(zhì)量滇南小耳豬參考基因組。
通過系統(tǒng)比較非洲野生豬科動物與歐亞家豬基因組的精細結(jié)構(gòu),他們發(fā)現(xiàn)非洲豬科動物共同祖先支系上產(chǎn)生的結(jié)構(gòu)變異和選擇信號與T細胞免疫、病毒感染和淋巴組織發(fā)育相關(guān)。其中,體細胞重排后參與編碼T細胞受體的TRBV27基因在非洲豬科動物中存在284個堿基對的缺失,導(dǎo)致相關(guān)T細胞受體缺乏對應(yīng)編碼區(qū),影響其T細胞受體對抗原呈遞細胞的識別,這可能與對非洲大陸上古老病原的免疫應(yīng)答相關(guān)。
研究人員對此前報道的與非洲豬瘟病毒抗性相關(guān)的CD163和RELA基因進行深入分析,發(fā)現(xiàn)與對非洲豬瘟病毒易感的歐亞家豬相比,非洲豬科動物的這兩個基因并未受到選擇或表現(xiàn)出快速進化的信號,這將有助于篩選家豬受非洲豬瘟病毒感染和致病關(guān)鍵基因,助力家豬抗病育種。國際著名刊物《分子生物學(xué)與進化》發(fā)表了這一研究成果。
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