記者6月21日從四川農(nóng)業(yè)大學(xué)獲悉，近日該校動科學(xué)院“豬遺傳育種團(tuán)隊(duì)”在《Nature Communications》上在線發(fā)表了題為“《豬不同組織基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控圖譜揭示組織特性及轉(zhuǎn)錄進(jìn)化動態(tài)》(A Pig BodyMap Transcriptome reveals Diverse Tissue Physiologies and Evolutionary Dynamics of Transcription)”的研究論文。該研究為深入解析豬肉質(zhì)性狀形成的分子機(jī)理，并為下一步分子育種的開展提供了重要基礎(chǔ)數(shù)據(jù)和理論支撐，同時(shí)也為促進(jìn)豬作為人類生物學(xué)和疾病的生物學(xué)模型奠定了基礎(chǔ)。

“豬肉的脂肪分皮下脂肪、肌間脂肪、肌內(nèi)脂肪三種。通常我們說的這塊肉太肥，指的是皮下脂肪太厚，而豬肉好吃的關(guān)鍵，要看肌內(nèi)脂肪含量?！痹撜撐牡谝蛔髡呓瘕堈f，這一研究正好揭示了豬肉好吃的秘密。

該研究特別針對豬重要經(jīng)濟(jì)性狀——骨骼肌生長開展研究。骨骼肌是動物軀體最重要的組成部分，占到產(chǎn)肉動物體重的約40%。肌纖維作為骨骼肌的主要組成單元，分為慢速氧化型(I型)、快速氧化型(IIa型)、快速酵解型(IIb型)與中間型(IIx型)4種，其類型的差異是影響產(chǎn)肉動物肌肉品質(zhì)的重要因素之一。

過去的大量研究通常將多種骨骼肌視作同一類組織，關(guān)于不同部位骨骼肌的遺傳和轉(zhuǎn)錄調(diào)控特性并未有精細(xì)、深入地探究。此次研究進(jìn)一步完整構(gòu)建了從頭部、前肢、軀干到后肢，共47種不同部位骨骼肌的精細(xì)轉(zhuǎn)錄調(diào)控圖譜，并明確了其在能量代謝和收縮特性等方面的分子調(diào)控差異，將為農(nóng)業(yè)動物產(chǎn)肉性狀提供重要指導(dǎo)。“比如現(xiàn)在炒回鍋肉喜歡用五花肉，也許以后用背脊肉也可以達(dá)到同樣的口感。”金龍介紹。

同時(shí)，此項(xiàng)研究為地方豬種資源的保護(hù)與利用也提供了更堅(jiān)實(shí)的理論基礎(chǔ)。四川是全國養(yǎng)豬大省，養(yǎng)豬歷史悠久，地方豬種資源豐富，有成華豬、內(nèi)江豬、雅南豬、烏金豬(涼山豬)、盆周山地豬(青峪豬和丫杈豬)等。

如何充分科學(xué)利用中國豐富地方豬種資源，培育兼顧生長性能和瘦肉率的新品種(系)，特別是在低背膘厚前提下維持合適的肌內(nèi)脂肪含量，以確保肉質(zhì)優(yōu)良，也是當(dāng)前農(nóng)業(yè)動物育種領(lǐng)域關(guān)注的熱點(diǎn)和難點(diǎn)。

此次研究在現(xiàn)有豬參考基因組基礎(chǔ)上，補(bǔ)充完善注釋了大量調(diào)控性轉(zhuǎn)錄本，包括19072個(gè)lncRNA(長鏈非編碼RNA)，2440個(gè)TUCPs(未知編碼潛能轉(zhuǎn)錄本)，48232個(gè)circRNAs(環(huán)狀RNA)和1245個(gè)miRNA(小RNA)。同時(shí)采用高通量染色質(zhì)空間構(gòu)象捕獲技術(shù)(Hi-C)重構(gòu)了豬脂肪組織的三維基因組空間結(jié)構(gòu)，在二維的“線性”基礎(chǔ)上，提供了基因調(diào)控的三維“空間”信息，為下一步分子育種的開展提供了重要基礎(chǔ)數(shù)據(jù)和理論支撐。

豬在人類攻克疾病研究領(lǐng)域發(fā)揮著越來越重要的作用，特別是在人類疾病模型、藥效學(xué)、異種細(xì)胞和器官移植等方面。本次研究也為促進(jìn)豬作為人類生物學(xué)和疾病的生物學(xué)模型奠定了基礎(chǔ)。

為充分明晰豬作為重要農(nóng)業(yè)動物和代謝相關(guān)疾病模式動物的代表性，在四川省人民醫(yī)院李貴森教授的協(xié)助下，該研究還同時(shí)比較了豬與人及其他模式動物基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控模式的差異，明晰了大量豬特異性基因調(diào)控模式。

“隨著這方面研究的繼續(xù)深入，也許以后豬不只用于吃肉，而可以更多用于醫(yī)學(xué)相關(guān)產(chǎn)業(yè)。對于豬的產(chǎn)業(yè)發(fā)展來說，也是一條值得探索的道路?！苯瘕埥榻B。