近日在哈爾濱市召開的“國際首例豬T2T全基因組組裝——民豬完整基因組構(gòu)建”成果發(fā)布會上，由國內(nèi)5個科研團(tuán)隊基于三代測序、ONT、Hi-C等前沿技術(shù)完成的豬T2T全基因組組裝——民豬完整基因組構(gòu)建成果，填補(bǔ)了豬T2T基因組組裝領(lǐng)域的空白，為豬遺傳育種和功能基因挖掘提供了高精度“藍(lán)圖”，標(biāo)志著豬基因組研究邁入“完整解析”新時代，成果達(dá)到國際領(lǐng)先水平。

這5個團(tuán)隊包括中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所張龍超研究員團(tuán)隊、黑龍江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧研究所劉娣研究員團(tuán)隊、重慶市畜牧科學(xué)院王金勇研究員團(tuán)隊、岳麓山實驗室印遇龍院士團(tuán)隊和四川農(nóng)業(yè)大學(xué)李明洲教授團(tuán)隊。發(fā)布會上，劉娣代表5個團(tuán)隊進(jìn)行了成果發(fā)布。專家組經(jīng)過集中討論，最后提出綜合評價結(jié)論。大家一致認(rèn)為，該成果不僅實現(xiàn)了豬基因組研究的里程碑式突破，更在應(yīng)用層面展現(xiàn)出多重優(yōu)勢：在基因組完整性方面為豬遺傳多樣性研究、進(jìn)化分析及疾病抗性基因挖掘提供完整參考；SV標(biāo)記的應(yīng)用顯著提升基因組選擇的效率，加速優(yōu)良性狀定向改良，實現(xiàn)精準(zhǔn)育種；冷適應(yīng)基因的發(fā)現(xiàn)為環(huán)境適應(yīng)性育種開辟新路徑，助力養(yǎng)殖業(yè)提質(zhì)增效，提高產(chǎn)業(yè)適配性。

劉娣介紹，這一研究成果有四大特點。一是基因組最完整，填補(bǔ)了國際空白。二是泛基因組最全面。三是發(fā)現(xiàn)了89個與冷適應(yīng)相關(guān)的候選基因，通過整合SV與RNA測序分析，進(jìn)一步鎖定17個與結(jié)構(gòu)變異直接關(guān)聯(lián)的冷適應(yīng)基因。四是育種應(yīng)用方面取得新突破，育種準(zhǔn)確度顯著提升。此外，團(tuán)隊通過精細(xì)定位發(fā)現(xiàn)調(diào)控豬體型的關(guān)鍵基因組區(qū)域CL3及核心SV位點，為高效選育優(yōu)質(zhì)種豬提供了新策略。

中國工程院院士、中國科學(xué)院亞熱帶農(nóng)業(yè)生態(tài)研究所研究員印遇龍認(rèn)為，用傳統(tǒng)技術(shù)育種至少要經(jīng)過5個世代，應(yīng)用新技術(shù)后，可以縮短育種進(jìn)程。這一成果對指導(dǎo)豬的生物育種，尤其是地方豬的生物育種具有非常重要的意義。